For-behandlingsstadiet: For det første gennemgår de genbrugte glasflasker en indledende screening og afviser ødelagte, stærkt forurenede eller uoprettelige flasker. Derefter fjernes etiketter, lim og andre klæbende stoffer fra flaskerne manuelt eller mekanisk for at forberede den efterfølgende rengøring.
Nedsænkningsrengøring: De for-behandlede flasker anbringes i en nedsænkningstank indeholdende rengøringsmiddel. Nedsænkningstiden afhænger af graden af forurening, generelt fra et par minutter til en halv time. Valget af rengøringsmiddel er afgørende og skal vælges ud fra flaskens materiale, type forurening og rengøringskrav. Det skal effektivt fjerne pletter uden at korrodere glasset.
Højtryksskylning: Efter nedsænkning skylles flaskerne med en høj-vandspistol eller roterende dyse for grundigt at fjerne rengøringsmiddelrester og genstridige pletter fra både indersiden og ydersiden af flasken. Tryk og flowhastighed af højtryksskylningen skal justeres i henhold til flaskens størrelse og form for at sikre effektiviteten af rengøringen.
Børstning og rengøring af indervægge: Til flasker med vanskelige-at-indvendige vægge kan børstning bruges. En speciel børste eller børstehoved indsættes i flasken til roterende skrubning. I mellemtiden er noget rengøringsudstyr også udstyret med en indvendig vægsprøjteanordning, som bruger-højtryksvandstråler til direkte at påvirke flaskens indervæg, hvilket forbedrer rengøringseffektiviteten.
Skylning og tørring: Efter rengøring placeres flaskerne i en skylletank og skylles med rent vand for at fjerne eventuelle resterende rengøringsmiddel. Derefter tørres flaskerne ved hjælp af varmluftcirkulation eller naturlig lufttørring for at forhindre, at fugtrester forårsager bakterievækst.